El río Mesa Inicia su recorrido en el municipio de Selas (Guadalajara) a 1272 metros sobre el nivel del mar y transcurre por angostas gargantas y fértiles vegas atravesando varios términos municipales de la provincia de Guadalajara antes de llegar a Calmarza, Jaraba e Ibdes, para finalizar su recorrido en el embalse de la Tranquera. 
Este río tiene un régimen variable a lo largo del año lo que provoca que en los meses más secos algún tramo permanezca sin agua, hasta encontrar algunos manantiales en Mochales y sobre todo en Jaraba, donde recoge gran parte de su caudal gracias a los manantiales termales y fuentes que surgen dentro del municipio.

El río recorre su valle creando paisajes de exquisita belleza con rincones en los que perderse y disfrutar de la naturaleza, ha ido labrando las laderas y ha convertido el territorio en lo que conocemos hoy.
Durante su recorrido por la provincia de Guadalajara y hasta llegar a Calmarza ha creado numerosos saltos de agua y cascadas, que en muchas ocasiones permiten frescos baños en época estival, en los vecinos pueblos de Algar de Mesa o Villel de Mesa, a los cuales deja el apellido.

Entrando en la provincia de Zaragoza, entre los municipios de Calmarza y Jaraba, la acción erosiva de las aguas superficiales del río y de las aguas subterráneas que circulan por el interior de la piedra caliza, se unen desde hace millones de años, abriendo esta hoz de unos 6 kilómetros, de paredes verticales de gran biodiversidad denominada CAÑÓN DEL RÍO MESA.

En el fondo del valle junto a las riberas del río aparecen los bosques galería en los que predominan los álamos blancos, los chopos y los sauces. En las sierras laterales destacan las formaciones de sabinas y romero.
En los cortados junto al río tienen su área de nidificación una gran variedad de aves y rapaces, siendo la más numerosa el buitre leonado. También es fácil avistar corzos y cabras montesas en las paredes y junto al río, cuyas aguas, puras y limpias, acojen una abundante fauna piscícola con tramos libres de pesca.

La geología de la zona con abundantes materiales calcáreos condiciona en gran medida un paisaje en el que el agua superficial es prácticamente inexistente, imitándose al pequeño cauce del río, que en las inmediaciones de Jaraba se enriquece con el agua proveniente de los más de 80 manantiales de aguas termales y mineromedicinales, que son los responsables del aumento del caudal del río durante todo el año.

Un itinerario señalizado como Sendero Turístico de Aragón, el sendero GR-24 recorre el fondo del cañón desde Jaraba hasta Calmarza (enlace GR 24), y continua hacia Algar de Mesa. 

Varios miradores no permiten disfrutar de las magníficas vistas del cañón desde la parte alta: Mirador del Mesa(enlace) y Mirador de los buitres(enlace).

El río continua su recorrido hacia Ibdes, donde el paisaje se convierte en un valle más abierto, remanso de paz y tranquilidad, donde desde antaño se han desarrollado fértiles huertas que aprovisionaban de frutas y verduras a los vecinos de ambos pueblos